RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	MYBL2	P10244	700 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	NUCB2	P80303	420 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	UROC1	Q96N76	676 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RASA4	O43374	803 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SRGN	P10124	158 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	APBA2	Q99767	749 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	NBN	O60934	754 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	AGR2	O95994	175 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	C7	P10643	843 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	FYB1	O15117	783 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SGTA	O43765	313 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ALF	Q53S48	1182 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TULP2	O00295	520 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC27A2	O14975	620 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	MUSK	O15146	869 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	CDR1	P51861	262 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483		F8VZ95	297 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF3B	O15066	747 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SNX2	O60749	519 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	VAMP4	O75379	141 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SMC2	O95347	1197 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	UBXN2A	P68543	259 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	IL33	O95760	270 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC4A1	P02730	911 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	EPB42	P16452	691 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	VAMP1	P23763	118 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	CNGA1	P29973	690 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RWDD2B	P57060	319 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	BPIFB3	P59826	476 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SYCP1	Q15431	976 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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