RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 GRIK4Q16099 956 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 TMC1Q8TDI8 760 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 EREGO14944 169 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 ITGB2P05107 769 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 CHRNA4P43681 627 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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PTPRC-214ENST00000530727 C9orf172C9J069 976 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRC-214ENST00000530727 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRC-214ENST00000530727 MAPK1P28482 360 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRC-214ENST00000530727 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRC-214ENST00000530727 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRC-214ENST00000530727 ADAM19Q9H013 955 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRC-214ENST00000530727 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 DLL1O00548 723 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRC-214ENST00000530727 H3BRJ5 948 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRC-214ENST00000530727 MBTPS1Q14703 1052 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-214ENST00000530727 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.42□□□□□ -1.38
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