RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505625.5

MATR3-211, Transcript of matrin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MATR3, Length 7,306 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3-211ENST00000505625 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 GOLIM4O00461 696 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 USO1O60763 962 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 TTC22Q5TAA0 569 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 EPSTI1Q96J88 318 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.91□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 SPA17Q15506 151 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 RETREG2Q8NC44 543 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 PANK2Q9BZ23 570 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 C6orf50Q9HD87 102 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 E7EVH7 732 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 SLC39A6Q13433 755 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 DLGAP5Q15398 846 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 ERFEQ4G0M1 354 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 CEP57Q86XR8 500 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 KRT13P13646 458 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 NAPAP54920 295 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 STRN3Q13033 797 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 RNF181Q9P0P0 153 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.9□□□□□ -1.46
MATR3-211ENST00000505625 IL1RL1Q01638 556 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 TRPC3Q13507 836 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 A0A1W2PRG0 241 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 VPS36Q86VN1 386 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 USP25Q9UHP3 1055 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 KIF5CO60282 957 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 DNM2P50570 870 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 MXRA7P84157 204 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 KIF5AQ12840 1032 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 MAP3K11Q16584 847 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 GLG1Q92896 1179 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.9□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ERBINQ96RT1 1412 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ELF1P32519 619 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 USP48Q86UV5 1035 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 PLIN2Q99541 437 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 DNAJC7Q99615 494 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 UPP2O95045 317 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 KIF21BO75037 1637 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ZMYND10O75800 440 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 PLCB3Q01970 1234 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CAMK4Q16566 473 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SNX19Q92543 992 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 MCM9Q9NXL9 1143 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 GGA1Q9UJY5 639 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CLRN2A0PK11 232 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SYCE3A1L190 88 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SMTNL1A8MU46 457 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CCDC14Q49A88 953 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 AKT3Q9Y243 479 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ERLIN1O75477 346 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ZBTB16Q05516 673 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 ZBTB9Q96C00 473 aa5.89□□□□□ -1.47
MATR3-211ENST00000505625 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms