RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493277.5

ZNF655-222, Transcript of zinc finger protein 655, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF655, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF655-222	ENST00000493277	VEGFB	P49765	207 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	BCAM	P50895	628 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	TATDN2	Q93075	761 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	SMAP	O00193	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	FOXN1	O15353	648 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ZNF655-222	ENST00000493277	AOC3	Q16853	763 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	LAMB2	P55268	1798 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	COL4A5	P29400	1685 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	EPS15	P42566	896 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	GRM1	Q13255	1194 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	RALBP1	Q15311	655 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ZNF428	Q96B54	188 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TAF1	P21675	1872 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SNED1	Q8TER0	1413 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ABCC4	O15439	1325 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SCNN1D	P51172	638 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	PTGDR	Q13258	359 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	MPND	Q8N594	471 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	BBOX1	O75936	387 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	LBX1	P52954	281 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	KRT24	Q2M2I5	525 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TRAF5	O00463	557 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	RAD17	O75943	681 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CXCL9	Q07325	125 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	GRAP	Q13588	217 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ECE1	P42892	770 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	TNIP1	Q15025	636 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	RUNDC1	Q96C34	613 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZNF655-222	ENST00000493277	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ZNF655-222	ENST00000493277	CHL1	O00533	1208 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ZNF655-222	ENST00000493277	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ZNF655-222	ENST00000493277	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77

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