RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 USP17L3A6NCW0 530 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 USP17L4A6NCW7 530 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 TAF5LO75529 589 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 CST9Q5W186 159 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 COA1Q9GZY4 146 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD44Q8N8A2 993 aa30.22■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
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PTPRD-210ENST00000481079 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
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PTPRD-210ENST00000481079 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 RASSF10A6NK89 507 aa30.2■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 DACT2Q5SW24 774 aa30.2■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
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PTPRD-210ENST00000481079 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRD-210ENST00000481079 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRD-210ENST00000481079 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
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PTPRD-210ENST00000481079 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRD-210ENST00000481079 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.17■■■□□ 2.42
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PTPRD-210ENST00000481079 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRD-210ENST00000481079 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
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PTPRD-210ENST00000481079 CD209Q9NNX6 404 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRD-210ENST00000481079 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
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PTPRD-210ENST00000481079 USP48Q86UV5 1035 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPRD-210ENST00000481079 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
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PTPRD-210ENST00000481079 MYOZ2Q9NPC6 264 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRD-210ENST00000481079 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRD-210ENST00000481079 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.11■■■□□ 2.41
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PTPRD-210ENST00000481079 IL1R1P14778 569 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRD-210ENST00000481079 GTF2IP78347 998 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRD-210ENST00000481079 SCARF1Q14162 830 aa30.1■■■□□ 2.41
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PTPRD-210ENST00000481079 GGA3Q9NZ52 723 aa30.1■■■□□ 2.41
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PTPRD-210ENST00000481079 LRRC24Q50LG9 513 aa30.09■■■□□ 2.41
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PTPRD-210ENST00000481079 THSD7BQ9C0I4 1608 aa30.07■■■□□ 2.4
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PTPRD-210ENST00000481079 CERS5Q8N5B7 392 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 BCAR3O75815 825 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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PTPRD-210ENST00000481079 OGFOD1Q8N543 542 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 MMP14P50281 582 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRD-210ENST00000481079 SULF1Q8IWU6 871 aa30.03■■■□□ 2.4
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PTPRD-210ENST00000481079 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.02■■■□□ 2.4
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PTPRD-210ENST00000481079 TNNQ9UQP3 1299 aa30.02■■■□□ 2.4
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PTPRD-210ENST00000481079 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
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PTPRD-210ENST00000481079 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 CDCA5Q96FF9 252 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 WBP1LQ9NX94 342 aa29.99■■■□□ 2.39
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