RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 OSBP2Q969R2 916 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 ADORA1P30542 326 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 SPC24Q8NBT2 197 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 FAM89AQ96GI7 184 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 WASHC4Q2M389 1173 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TNS2Q63HR2 1409 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 XAGE2Q96GT9 111 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 KIF3AQ9Y496 699 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.08■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 CBX8Q9HC52 389 aa24.07■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 SLAIN2Q9P270 581 aa24.07■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 HAND2P61296 217 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 PAPPAQ13219 1627 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 GUCY1B3Q02153 619 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 SCARF1Q14162 830 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 FBXO3Q9UK99 471 aa24.04■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ZAP70P43403 619 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 TPM3P06753 285 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 PI16Q6UXB8 463 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 SYNE4Q8N205 404 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 PIGBQ92521 554 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 LAMA4Q16363 1823 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 ZNF165P49910 485 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 USP28Q96RU2 1077 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-208ENST00000460766 FOXP2O15409 715 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 GPTP24298 496 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 STARD3NLO95772 234 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 FGAP02671 866 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 CSF1RP07333 972 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 METTL24Q5JXM2 366 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 SPEF2Q9C093 1822 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 APPBP2Q92624 585 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 CHMP4CQ96CF2 233 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ATP2B3Q16720 1220 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 TRIM5Q9C035 493 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 DYNC1I1O14576 645 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 HLFQ16534 295 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 DRC7Q8IY82 874 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 PRC1O43663 620 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 PTGS1P23219 599 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ITGA6P23229 1130 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ME1P48163 572 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 ATL3Q6DD88 541 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-208ENST00000460766 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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