RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.28■□□□□ 0.52
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PODNQ7Z5L7 613 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP48Q86UV5 1035 aa18.26■□□□□ 0.51
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNJ4P48050 445 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GGA3Q9NZ52 723 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLIN1O60240 522 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CD209Q9NNX6 404 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CERS5Q8N5B7 392 aa18.2■□□□□ 0.5
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRM1Q13255 1194 aa18.19■□□□□ 0.5
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 JAG2Q9Y219 1238 aa18.19■□□□□ 0.5
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IL1R1P14778 569 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SASH1O94885 1247 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDCA5Q96FF9 252 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WBP1LQ9NX94 342 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GYG1P46976 350 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WNT10BO00744 389 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE4AQ14139 1066 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SULF1Q8IWU6 871 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCAR3O75815 825 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFFO2Q5TF58 517 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZIC5Q96T25 663 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MEIS3Q99687 375 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AOX1Q06278 1338 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.14■□□□□ 0.49
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