RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 PRC1O43663 620 aa15.92■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 KIF20AO95235 890 aa15.92■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.92■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 PIK3C2BO00750 1634 aa15.92■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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SGMS1-203ENST00000429490 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.91■□□□□ 0.14
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SGMS1-203ENST00000429490 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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SGMS1-203ENST00000429490 STRN4Q9NRL3 753 aa15.89■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 ERICH2A1L162 156 aa15.89■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 E7EWF7 191 aa15.89■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 CCP110O43303 1012 aa15.89■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF202O95125 648 aa15.89■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 ST3GAL1Q11201 340 aa15.89■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 USP32Q8NFA0 1604 aa15.88■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.87■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 NCOA7Q8NI08 942 aa15.87■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 MCM6Q14566 821 aa15.87■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 SIRT1Q96EB6 747 aa15.87■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 23.1
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SGMS1-203ENST00000429490 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.87■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 ZSCAN12O43309 604 aa15.87■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.87■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 AIDAQ96BJ3 306 aa15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.86■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.86■□□□□ 0.13
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SGMS1-203ENST00000429490 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 TBX22Q9Y458 520 aa15.86■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.85■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 ATP1A3P13637 1013 aa15.85■□□□□ 0.13
SGMS1-203ENST00000429490 AFMP43652 599 aa15.85■□□□□ 0.13
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