RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MSL1Q68DK7 614 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 REC8O95072 547 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP5JP18859 108 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METTL24Q5JXM2 366 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EVI5LQ96CN4 794 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEUROD6Q96NK8 337 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMC4Q7Z404 712 aa11.92□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.92□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.92□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPEF2Q9C093 1822 aa11.92□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GUL7 405 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SGSM2O43147 1006 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLD1P28340 1107 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADORA1P30542 326 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRAPQ13588 217 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRY2Q49AN0 593 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL4A1P02462 1669 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTFR1LQ9H019 292 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE8BO95263 885 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPR1P16066 1061 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALDH1B1P30837 517 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNX21Q969T3 373 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HAUS7Q99871 368 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAF1P21675 1872 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H0YIN7 160 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BBOX1O75936 387 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP2B3Q16720 1220 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GORABQ5T7V8 394 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XAGE2Q96GT9 111 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM227BQ96M60 508 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSD1Q9BTV5 496 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PALD1Q9ULE6 856 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC5A1P13866 664 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RABEP1Q15276 862 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSCBQ8IWL3 235 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LPIN2Q92539 896 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MASTLQ96GX5 879 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0D9SFI3 127 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHGBP05060 677 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRGNP10124 158 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNJ4P48050 445 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTH1RQ03431 593 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHRNDQ07001 517 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAD50Q92878 1312 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIP1O00291 1037 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE4AQ14139 1066 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STYK1Q6J9G0 422 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GUL6 1792 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLIM4O00461 696 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB7AO95365 584 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FGFR2P21802 821 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MCCP23508 829 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSPA4P34932 840 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCARF1Q14162 830 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTC39AQ5SRH9 613 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNKSR1Q969H4 720 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms