RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 BCAMP50895 628 aa26.28■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 GRAPQ13588 217 aa26.28■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 BECN1Q14457 450 aa26.28■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.28■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 MYH7P12883 1935 aa26.27■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 HSPA4P34932 840 aa26.27■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 UBE4AQ14139 1066 aa26.27■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 MSL1Q68DK7 614 aa26.27■■□□□ 1.8
RBMS1-205ENST00000409972 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.26■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.26■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 MMP10P09238 476 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 BAG6P46379 1132 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 ILDR2Q71H61 639 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 TICAM2Q86XR7 235 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 SNX21Q969T3 373 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 STK32BQ9NY57 414 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.25■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 MCCP23508 829 aa26.24■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 RASGRF1Q13972 1273 aa26.24■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 RABEP1Q15276 862 aa26.24■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.24■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 IL17RAQ96F46 866 aa26.24■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.23■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.23■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 MAP4K1Q92918 833 aa26.23■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.23■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 KLRK1P26718 216 aa26.22■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 GYG1P46976 350 aa26.22■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 ANAPC15P60006 121 aa26.22■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 SPATA5Q8NB90 893 aa26.22■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 RASEFQ8IZ41 740 aa26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.21■■□□□ 1.79
RBMS1-205ENST00000409972 NECTIN1Q15223 517 aa26.2■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 OSBP2Q969R2 916 aa26.19■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.19■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 DOCK2Q92608 1830 aa26.19■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 HSCBQ8IWL3 235 aa26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 MAST3O60307 1309 aa26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 KCNB2Q92953 911 aa26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 M0R2C6 588 aa26.17■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 KCNJ4P48050 445 aa26.17■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.17■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.16■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 BBOX1O75936 387 aa26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 SRGNP10124 158 aa26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 ADD2P35612 726 aa26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 GPSM2P81274 684 aa26.14■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 VPS53Q5VIR6 699 aa26.14■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.14■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.14■■□□□ 1.78
RBMS1-205ENST00000409972 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.14■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 APPBP2Q92624 585 aa26.14■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.14■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 XDHP47989 1333 aa26.13■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 NEK4P51957 841 aa26.13■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 WASHC4Q2M389 1173 aa26.13■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.13■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.13■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 SLC27A2O14975 620 aa26.12■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.12■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.11■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 PDE6BP35913 854 aa26.11■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 VPS37DQ86XT2 251 aa26.11■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.11■■□□□ 1.77
RBMS1-205ENST00000409972 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms