RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 STX1AQ16623 288 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 ATG3Q9NT62 314 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CHRNA2Q15822 529 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 SARM1Q6SZW1 724 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 ZMYND15Q9H091 742 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 TIMM10P62072 90 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 FBXL16Q8N461 479 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GUL7 405 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 IQCB1Q15051 598 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 TSC1Q92574 1164 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 USP28Q96RU2 1077 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 KINO60870 393 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 FOSBP53539 338 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 LRMPQ12912 555 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC24Q50LG9 513 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 EVCP57679 992 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 M0R2C6 588 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JLW4 131 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ANO10Q9NW15 660 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ME1P48163 572 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 MYH7P12883 1935 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 NEMFO60524 1076 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 FSIP1Q8NA03 581 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO3Q9UK99 471 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS3-201ENST00000355530 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 TNS2Q63HR2 1409 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC12Q96J65 1359 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 BECN2A8MW95 431 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 OSBP2Q969R2 916 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 ARID3AQ99856 593 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.32■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 A1BGP04217 495 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 CHST3Q7LGC8 479 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQ27 194 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQ64 194 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQD8 194 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 SMTNL1A8MU46 457 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 GUCY1B3Q02153 619 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPNS3-201ENST00000355530 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
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