RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PIBF1Q8WXW3 757 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LTN1O94822 1766 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH1L1O75891 902 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 APLP1P51693 650 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PROSER3Q2NL68 480 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 DDX11Q96FC9 970 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GGA3Q9NZ52 723 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ERBB4Q15303 1308 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PLCG2P16885 1265 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CTSWP56202 376 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 DPF3Q92784 378 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF853P0CG23 659 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 HOXD10P28358 340 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 STYK1Q6J9G0 422 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ALS2Q96Q42 1657 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 HTRA3P83110 453 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 G2E3Q7L622 706 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RAET1EQ8TD07 263 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LNPKQ9C0E8 428 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 STX8Q9UNK0 236 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 BCL9LQ86UU0 1499 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CA8P35219 290 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM10P62072 90 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 OLFM4Q6UX06 510 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NAPBQ9H115 298 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GREM2Q9H772 168 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ATRNO75882 1429 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GLTPD2A6NH11 291 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GOLIM4O00461 696 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CPLX1O14810 134 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNDQ07001 517 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PODNQ7Z5L7 613 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TTC6Q86TZ1 520 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PROM2Q8N271 834 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD5Q96G74 571 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MCM9Q9NXL9 1143 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 HOXB7P09629 217 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GCKRQ14397 625 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SP8Q8IXZ3 490 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SCLT1Q96NL6 688 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 EPS15P42566 896 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP100Q494V2 611 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CPXCR1Q8N123 301 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SPC25Q9HBM1 224 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 VAT1LQ9HCJ6 419 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TNNQ9UQP3 1299 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MEGF6O75095 1541 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM27P14373 513 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 DDR1Q08345 913 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC102AQ96A19 550 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LRRCC1Q9C099 1032 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 COA1Q9GZY4 146 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 EYA2O00167 538 aa5.3□□□□□ -1.56
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