RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CNBD1Q8NA66 436 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 TAF1P21675 1872 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 DDIT3P35638 169 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 TM4SF1P30408 202 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 POTEAQ6S8J7 498 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 SLC27A2O14975 620 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 RNF20Q5VTR2 975 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 ZNF827Q17R98 1081 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 AKT1S1Q96B36 256 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 HMG20BQ9P0W2 317 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 SERPINB2P05120 415 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 BCAMP50895 628 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 UBE4AQ14139 1066 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 SPATA5Q8NB90 893 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 MAST3O60307 1309 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 NFKBIBQ15653 356 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 FBXO41Q8TF61 875 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 OSBP2Q969R2 916 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 RASGRF1Q13972 1273 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 WASHC4Q2M389 1173 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 TMX3Q96JJ7 454 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 TTC14Q96N46 770 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 M0R2C6 588 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 ST5P78524 1137 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 APPBP2Q92624 585 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 VPS53Q5VIR6 699 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GUL6 1792 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 PSMA5P28066 241 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CPA1P15085 419 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 ADD2P35612 726 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 DDR1Q08345 913 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 RUFY3Q7L099 469 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 GYG1P46976 350 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 GRAPQ13588 217 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 MYH7P12883 1935 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 AK2P54819 239 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 UBE3CQ15386 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CYP21A2P08686 494 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CUL4AQ13619 759 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 KRT32Q14532 448 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CRY2Q49AN0 593 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 PDE6AP16499 860 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 VPS37DQ86XT2 251 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K12Q12852 859 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.1 ms