RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.49■■□□□ 1.83
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HOXD1-201ENST00000331462 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 APOBRQ0VD83 1088 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM5Q9C035 493 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 IQCB1Q15051 598 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 CHRNA2Q15822 529 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.47■■□□□ 1.83
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HOXD1-201ENST00000331462 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 TIMM10P62072 90 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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HOXD1-201ENST00000331462 TNS2Q63HR2 1409 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1B0GUL7 405 aa26.45■■□□□ 1.82
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HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO3Q9UK99 471 aa26.45■■□□□ 1.82
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HOXD1-201ENST00000331462 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.44■■□□□ 1.82
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HOXD1-201ENST00000331462 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC24Q50LG9 513 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.44■■□□□ 1.82
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC12Q96J65 1359 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 M0R2C6 588 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CTIFO43310 598 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 DRC7Q8IY82 874 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JLW4 131 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
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HOXD1-201ENST00000331462 LRMPQ12912 555 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
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HOXD1-201ENST00000331462 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 KINO60870 393 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 TSC1Q92574 1164 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 OSBP2Q969R2 916 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PQ27 194 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PQ64 194 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PQD8 194 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 NEMFO60524 1076 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 A1BGP04217 495 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA2P54652 639 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 RGS22Q8NE09 1264 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 ANO10Q9NW15 660 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 FOXP2O15409 715 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.37■■□□□ 1.81
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HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD7Q92527 254 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 ADALQ6DHV7 355 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXD1-201ENST00000331462 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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