RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268082.4

CCDC33-201, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC33, Length 2,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-201ENST00000268082 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SPATA32Q96LK8 384 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CHD4Q14839 1912 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 DTNBO60941 627 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 C4AP0C0L4 1744 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 C4BP0C0L5 1744 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 A0A1B0GUL7 405 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 JAK2O60674 1132 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CHGBP05060 677 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 LRRC24Q50LG9 513 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 BRF1Q92994 677 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 KIF3AQ9Y496 699 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 MAST3O60307 1309 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 LIG1P18858 919 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TIMM10P62072 90 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SCRN1Q12765 414 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TCIRG1Q13488 830 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 FBXL16Q8N461 479 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 DOCK2Q92608 1830 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TPM3P06753 285 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CFAP45Q9UL16 551 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 E7EWF7 191 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 H3BQV1 296 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 IFFO2Q5TF58 517 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 ATL3Q6DD88 541 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 LRP5O75197 1615 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 FGD1P98174 961 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TYRO3Q06418 890 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 TNMDQ9H2S6 317 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 DACT1Q9NYF0 836 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 CSF1RP07333 972 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 EVCP57679 992 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 PGBD1Q96JS3 809 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 CTDNEP1O95476 244 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 M0R2C6 588 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 APOBRQ0VD83 1088 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 LAMB2P55268 1798 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 AP5Z1O43299 807 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 CAVIN2O95810 425 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 XAGE2Q96GT9 111 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC33-201ENST00000268082 BICD2Q8TD16 824 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms