RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 LPIN2Q92539 896 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 CHGBP05060 677 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 STX6O43752 255 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 FGFR2P21802 821 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 APPBP2Q92624 585 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 ZAP70P43403 619 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 MRE11P49959 708 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 MBD3O95983 291 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 SYT1P21579 422 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 SCARF1Q14162 830 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 NHSQ6T4R5 1651 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 GJB2P29033 226 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 ST3GAL1Q11201 340 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD9-201ENST00000249499 MCAMP43121 646 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 OSBP2Q969R2 916 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 M0R2C6 588 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 SLC5A1P13866 664 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 PDCP20941 246 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 SCN7AQ01118 1682 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 MYH7P12883 1935 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC102BQ68D86 513 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 F13A1P00488 732 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF445P59923 1031 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 UBE3CQ15386 1083 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 WASHC4Q2M389 1173 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 ADD2P35612 726 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 FAM182BQ5T319 152 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 FBXL16Q8N461 479 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 NECAB1Q8N987 351 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 BTAF1O14981 1849 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 Q6ZUG5 572 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 MTMR6Q9Y217 621 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD9-201ENST00000249499 RPS6KA4O75676 772 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 GPT2Q8TD30 523 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 GTF3C6Q969F1 213 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 FAM177BA6PVY3 158 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 E7EWF7 191 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 PHKA1P46020 1223 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 PI16Q6UXB8 463 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 NARFQ9UHQ1 456 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 LAMA4Q16363 1823 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 GPAA1O43292 621 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 NYXQ9GZU5 481 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 FOXP2O15409 715 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 PFKFB2O60825 505 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 SPATA5Q8NB90 893 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 FGD1P98174 961 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXD9-201ENST00000249499 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms