RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ETV6P41212 452 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RANBP1P43487 201 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRA4P48169 554 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EMDP50402 254 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ETV1P50549 477 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RORCP51449 518 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BCAP31P51572 246 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP12AP54707 1039 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GFERP55789 205 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFA1P59665 94 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFA3P59666 94 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BDH1Q02338 343 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OXA1LQ15070 435 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ULK3Q6PHR2 472 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FCRLAQ7L513 359 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PHC2Q8IXK0 858 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB119Q8N690 84 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52N1Q8NH53 320 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1L3Q8NH93 324 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DOK4Q8TEW6 326 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AP3S1Q92572 193 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ART5Q96L15 291 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD7Q96MP8 289 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 VSTM2LQ96N03 204 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LPAR4Q99677 370 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZPBPQ9BS86 351 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC32Q9BV29 185 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MROQ9BYG7 248 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SP140LQ9H930 580 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CMC2Q9NRP2 79 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CUTCQ9NTM9 273 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF175Q9Y473 711 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10H1Q9Y4A9 318 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BRWD1Q9NSI6 2320 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GWA3 101 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PS18 150 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FUOMA2VDF0 154 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EFCAB7A8K855 629 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BHLHE40O14503 412 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CCSO14618 274 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS5O15539 181 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2B3O76000 313 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 STK17BO94768 372 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CDRT1O95170 752 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB2O95178 105 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LYPD3O95274 346 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NTN1O95631 604 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R3DO95685 299 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PTTG1O95997 202 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TSHBP01222 138 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1D-16P01601 117 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 APOA1P02647 267 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LIMS3P0CW19 117 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LIMS4P0CW20 117 aa3.57□□□□□ -1.84
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