RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577524.5

ARHGAP28-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 28, human

TSL 5

Gene ARHGAP28, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NF1	P21359	2839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LGALS8	O00214	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EREG	O14944	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GSC2	O15499	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MLNR	O43193	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PRODH	O43272	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ADAM20	O43506	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FAM20B	O75063	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TIPRL	O75663	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	WNT2	P09544	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLU	P10909	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF12	P17014	697 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ADRA2C	P18825	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PRKACG	P22612	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GATA4	P43694	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NPY4R	P50391	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CRISP1	P54107	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524		Q8TCH9	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DDO	Q99489	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MED20	Q9H944	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	POMP	Q9Y244	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524		A8MXK9	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524		G3V2T6	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PHYH	O14832	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SELENOF	O60613	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	VENTX	O95231	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FSTL3	O95633	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LIPF	P07098	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CD80	P33681	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MAP2K3	P46734	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HILS1	P60008	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ESRRG	P62508	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CDK5	Q00535	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	BAMBI	Q13145	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	APOF	Q13790	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MPPED2	Q15777	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PCK2	Q16822	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MICB	Q29980	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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