RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558040.5

SNX1-203, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-203ENST00000558040 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 A0A1W2PPW3 197 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 DPRXA6NFQ7 191 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ABCD4O14678 606 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 LMX1BO60663 402 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RAC2P15153 192 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 BSPH1Q075Z2 132 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 BEX5Q5H9J7 111 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 POFUT1Q9H488 388 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 FAHP16930 419 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 GCH1P30793 250 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 KIR2DL3P43628 341 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MXD1Q05195 221 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SLC22A25Q6T423 547 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 NUP37Q8NFH4 326 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CHST5Q9GZS9 411 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 NEK6Q9HC98 313 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 KALRNO60229 2985 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 HCFC1P51610 2035 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MEGF11A6BM72 1044 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 WIPF3A6NGB9 483 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CD300LBA8K4G0 201 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CD3EP07766 207 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RAB3AP20336 220 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RAB3BP20337 219 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ACKR3P25106 362 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SOX6P35712 828 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 GLRXP35754 106 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 PSMD7P51665 324 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ERVS71-1P61550 626 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SPOCK1Q08629 439 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 UTS2BQ765I0 119 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ORAI1Q96D31 301 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 HAVCR1Q96D42 359 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CMBLQ96DG6 245 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 TECTBQ96PL2 329 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SHISA3A0PJX4 238 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 A6NIN4 97 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SULT1B1O43704 296 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MAS1P04201 325 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RORCP51449 518 aa14.49□□□□□ -0.09
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SNX1-203ENST00000558040 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 FAM222BQ8WU58 562 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 PIGTQ969N2 578 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 TPK1Q9H3S4 243 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 RTTNQ86VV8 2226 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 VSTM5A8MXK1 200 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 MAGEB3O15480 346 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 ALX3O95076 343 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 CST4P01036 141 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 NRASP01111 189 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX1-203ENST00000558040 BDKRB2P30411 391 aa14.48□□□□□ -0.09
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