RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	FCRL1	Q96LA6	429 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PKMYT1	Q99640	499 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PRRT1	Q99946	306 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	IL36A	Q9UHA7	158 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GBF1	Q92538	1859 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	COL4A6	Q14031	1691 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		A0A087WV48	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		A6NIZ1	184 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	C17orf105	B2RV13	164 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		G3V2L1	256 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		M0R143	59 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CCL24	O00175	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	HAS3	O00219	553 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SDHD	O14521	159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	UBD	O15205	165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SLC16A4	O15374	487 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ARPC5	O15511	151 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MBTPS2	O43462	519 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RNF13	O43567	381 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CEACAM4	O75871	244 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GLCE	O94923	617 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	STBD1	O95210	358 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	FGF19	O95750	216 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PIGR	P01833	764 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MT-ND4L	P03901	98 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CD2	P06729	351 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPA8	P0DM63	369 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GABRA1	P14867	456 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TBXA2R	P21731	343 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	AADAC	P22760	399 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SDC2	P34741	201 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SOX3	P41225	446 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GCLM	P48507	274 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GSK3B	P49841	420 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CCR6	P51684	374 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM50B	P56557	158 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RAB11A	P62491	216 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	VLDLR	P98155	873 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SKP2	Q13309	424 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ENPP2	Q13822	863 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RAB11B	Q15907	218 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SPIN4	Q56A73	249 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PYY3	Q5JQD4	70 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ULK3	Q6PHR2	472 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PID1	Q7Z2X4	250 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LAX1	Q8IWV1	398 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SLC34A3	Q8N130	599 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF675	Q8TD23	568 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.76	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81

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