RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ZNF19P17023 458 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PITPNAQ00169 270 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TPBGQ13641 420 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SNCBQ16143 134 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 BSXQ3C1V8 233 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RAB43Q86YS6 212 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 VAT1Q99536 393 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ING2Q9H160 280 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PORCNQ9H237 461 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SCML1Q9UN30 329 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ABCC2Q92887 1545 aa3.49□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 A0A0J9YXY3 114 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ISPDA4D126 451 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FABP12A6NFH5 140 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6L10A6NI86 522 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 H7C1H1 209 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ZW10O43264 779 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 AQP9O43315 295 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 COCHO43405 550 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SGCEO43556 437 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MYO1DO94832 1006 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 KRT7P08729 469 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PGA5P0DJD9 388 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CNR1P21554 472 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GABRR1P24046 479 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP5-9P26371 169 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TEAD1P28347 426 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GNRHRP30968 328 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 HOXA6P31267 233 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PFN2P35080 140 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MAGEA3P43357 314 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 DMC1Q14565 340 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RFX4Q33E94 735 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ITPRIPQ8IWB1 547 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR8G5Q8NG78 346 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TMEM234Q8WY98 164 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RBBP8Q99708 897 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GABRG3Q99928 467 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 IFT46Q9NQC8 304 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 C1orf109Q9NX04 203 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.48□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GRIN2AQ12879 1464 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GRIN2BQ13224 1484 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CLDN34H7C241 214 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PLPP3O14495 311 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR5F1O95221 314 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TTC4O95801 387 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TIMP1P01033 207 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OXTP01178 125 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 FABP3P05413 133 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR5AL1P0C617 328 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CHTF8P0CG12 524 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PGA4P0DJD7 388 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PGA3P0DJD8 388 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CD1EP15812 388 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ATF6P18850 670 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CEACAM6P40199 344 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PPICP45877 212 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PPP1CBP62140 327 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SLC35A1P78382 337 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SMARCB1Q12824 385 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RGS21Q2M5E4 152 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 IDNKQ5T6J7 187 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ATPAF2Q8N5M1 289 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 OR5AK3PQ8NH89 298 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SFXN5Q8TD22 340 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms