RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 LMX1BO60663 402 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TPST2O60704 377 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TRAPPC6AO75865 159 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF682O95780 498 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 SEMG1P04279 462 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 PRB1P04280 392 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 GKN3PP0CG01 181 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 PRG2P13727 222 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 PGCP20142 388 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 GIFP27352 417 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 HTR2AP28223 471 aa4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 PAX9P55771 341 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 MS4A2Q01362 244 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 HSF2Q03933 536 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 FOXF1Q12946 379 aa4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 RAET1LQ5VY80 246 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 CARM1Q86X55 608 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 HOGA1Q86XE5 327 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR4D11Q8NGI4 311 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR6T1Q8NGN1 323 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF563Q8TA94 476 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM234Q8WY98 164 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TPD52L3Q96J77 140 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 RAB40CQ96S21 281 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TRIM15Q9C019 465 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 LAMP5Q9UJQ1 280 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 NPIPA1Q9UND3 350 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 POMPQ9Y244 141 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.99□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A0B4J2E0 115 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1B0GTH9 108 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1B0GX12 115 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 STAMBPO95630 424 aa4.98□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF708P17019 499 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 GCKP35557 465 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 SOX6P35712 828 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR1E2P47887 323 aa4.98□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 COPZ1P61923 177 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 HOXC5Q00444 222 aa4.98□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 SELENBP1Q13228 472 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR1Q1Q15612 314 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 C3orf33Q6P1S2 294 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF613Q6PF04 617 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 GRINAQ7Z429 371 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 OR6S1Q8NH40 331 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 THRSPQ92748 146 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 MCHR2Q969V1 340 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
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PRPF4B-204ENST00000466185 TXN2Q99757 166 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF416Q9BWM5 594 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 EXO5Q9H790 373 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 C12orf10Q9HB07 376 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 PALMDQ9NP74 551 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 ACER3Q9NUN7 267 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.98□□□□□ -1.61
PRPF4B-204ENST00000466185 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.98□□□□□ -1.61
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