RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 PSENENQ9NZ42 101 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 H3BP45 60 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SDHBP21912 280 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 PRDX4Q13162 271 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 DLL4Q9NR61 685 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SLC31A2O15432 143 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 PMP22Q01453 160 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 OR4C3Q8NH37 302 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 LAMA4Q16363 1823 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 OR2F2O95006 317 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 C1QBP02746 253 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 FOSL1P15407 271 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 PPP1CAP62136 330 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 ZPBPQ9BS86 351 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF766Q5HY98 468 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 YIPF6Q96EC8 236 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 SOX7Q9BT81 388 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A6P12236 298 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 CT45A10P0DMU9 189 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 MPLP40238 635 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 NRTNQ99748 197 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 DEFA6Q01524 100 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 UMAD1C9J7I0 102 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 EPXP11678 715 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF83P51522 516 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 GSG1Q2KHT4 349 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 GPX8Q8TED1 209 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 AQP6Q13520 282 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 ZG16BQ96DA0 208 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 IER2Q9BTL4 223 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 DEFB108AA8MXU0 73 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 CCL2P13500 99 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 TFF2Q03403 129 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF90Q03938 601 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRF-209ENST00000438120 OXA1LQ15070 435 aa15.43■□□□□ 0.06
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