RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 SVBPQ8N300 66 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 PTP4A3O75365 173 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 NGFRP08138 427 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 CCL2P13500 99 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 AICDAQ9GZX7 198 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 A0A1W2PR80 420 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 WDR1O75083 606 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 RASL10BQ96S79 203 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 EXD3Q8N9H8 876 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 DLL4Q9NR61 685 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF205O95201 554 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 CD96P40200 585 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 OR3A4PP47883 348 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 EFNB2P52799 333 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 EDDM3BP56851 147 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 PRR13Q9NZ81 148 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ACSM4P0C7M7 580 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 IL11P20809 199 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 GAB4Q2WGN9 574 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF774Q6NX45 483 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 S100PBPQ96BU1 408 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 POLEQ07864 2286 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SNAPINO95295 136 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 KISS1Q15726 138 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 IFNA1P01562 189 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 DHRS2Q13268 280 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TOR2AQ5JU69 321 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 RNLSQ5VYX0 342 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 CDH26Q8IXH8 852 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 LRRC46Q96FV0 321 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 FOXB1Q99853 325 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SIRPB1O00241 398 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 CLDN1O95832 211 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 LGI3Q8N145 548 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 LHX6Q9UPM6 363 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SCN5AQ14524 2016 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 HSPB2A8KAH6 182 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 NME2P1O60361 137 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 GALNSP34059 522 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ERVK-16P61578 105 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC10A1Q14973 349 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 HSPB2Q16082 182 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 LYG2Q86SG7 212 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TERB2Q8NHR7 220 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 MARC2Q969Z3 335 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 SEH1LQ96EE3 360 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 AMELYQ99218 206 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 DEGS1O15121 323 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ACTL6BO94805 426 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 PPP1R1AQ13522 171 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 D2HGDHQ8N465 521 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TCEAL3Q969E4 200 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 MUCL1Q96DR8 90 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 KCNJ15Q99712 375 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-205ENST00000409483 MFRPQ9BY79 579 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms