RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 MT-CO3P00414 261 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ID4P47928 161 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CLDN6P56747 220 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GGTLC2Q14390 218 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 DOCK7Q96N67 2140 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFSF15O95150 251 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CD63P08962 238 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 HOXC12P31275 282 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CTXN1P60606 82 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 Q3ZCU0 254 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 RHOVQ96L33 236 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A0B4J2E0 115 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GX12 115 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GLCEO94923 617 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 PGCP20142 388 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MAP3K8P41279 467 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ACBD4Q8NC06 268 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 OR5B2Q96R09 309 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MPDZO75970 2070 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 C9orf170A2RU37 121 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDT19A8MXV4 375 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 LRP3O75074 770 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MT-ND4LP03901 98 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 OR8U8P0C7N1 319 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 HSD11B1P28845 292 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CAV2P51636 162 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SSTP61278 116 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SKP2Q13309 424 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF611Q8N823 705 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 S100PBPQ96BU1 408 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM10Q96HG1 83 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF122Q9H9V4 155 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GV90 55 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 HRKO00198 91 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 UPK3AO75631 287 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ARG1P05089 322 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CRHP06850 196 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 FOLR2P14207 255 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 EMDP50402 254 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SSX9Q7RTT3 188 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM234Q8WY98 164 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SGK3Q96BR1 496 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 RGCCQ9H4X1 137 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 SERINC4A6NH21 518 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MSGN1A6NI15 193 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM127O75204 238 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 UTS2O95399 124 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GPANK1O95872 356 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-9P01782 118 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 PPICP45877 212 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MST1LQ2TV78 715 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 AWAT1Q58HT5 328 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 HES3Q5TGS1 186 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 IP6K3Q96PC2 410 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 GGACTQ9BVM4 153 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RPRD1B-201ENST00000373433 CKLFQ9UBR5 152 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.7 ms