RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 OR1J1Q8NGS3 322 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 SGK3Q96BR1 496 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 TMED9Q9BVK6 235 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 POFUT1Q9H488 388 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM212A6NML5 194 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 GPRIN2O60269 458 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINA3P01011 423 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 TUBG1P23258 451 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 THBS4P35443 961 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 GLRXP35754 106 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB10P48595 397 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 AGAP6Q5VW22 663 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 MUC15Q8N387 334 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 SPSB4Q96A44 273 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 CCL19Q99731 98 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 RGCCQ9H4X1 137 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 TUBG2Q9NRH3 451 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 RAF1P04049 648 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 ISG15P05161 165 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 ERVS71-1P61550 626 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 SLC3A1Q07837 685 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 MALLQ13021 153 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 LSAMPQ13449 338 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 ODF4Q2M2E3 257 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 CDH24Q86UP0 819 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 REEP6Q96HR9 211 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 LYZL4Q96KX0 146 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 KCTD7Q96MP8 289 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 LAMP3Q9UQV4 416 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 CMAHPQ9Y471 501 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 APCP25054 2843 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GTI1 187 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 P2RY10O00398 339 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 OR4A8P0C604 315 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 DANCRP0C864 163 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 CCL1P22362 96 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 DNASE1P24855 282 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 FABP5Q01469 135 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF92Q03936 586 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 ADIPOQQ15848 244 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 RDH10Q8IZV5 341 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM171Q8WVE6 324 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 GHSRQ92847 366 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 GPR84Q9NQS5 396 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 GABRPO00591 440 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 SOD3P08294 240 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 ACHEP22303 614 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 FBXW12Q6X9E4 464 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 OPA3Q9H6K4 179 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 ITPR2Q14571 2701 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 NOTCH2Q04721 2471 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 SOX6P35712 828 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 TGFBR1P36897 503 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINF1P36955 418 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 C22orf42Q6IC83 251 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZSR3 168 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 DTX2Q86UW9 622 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 PIGTQ969N2 578 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 SOX7Q9BT81 388 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 PLK3Q9H4B4 646 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 POLQO75417 2590 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD11-201ENST00000249504 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms