RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DVL1	O14640	695 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A2	O15244	555 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GPR137B	O60478	399 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC22	O60826	627 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GMFB	P60983	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ECH1	Q13011	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ST8SIA4	Q92187	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PYURF	Q96I23	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CCL13	Q99616	98 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CITED1	Q99966	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	VWF	P04275	2813 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ARPC3	O15145	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TBX1	O43435	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GMDS	O60547	372 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GMNN	O75496	209 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FSTL3	O95633	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TFF1	P04155	84 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GYPB	P06028	91 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SPARC	P09486	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RRM2	P31350	389 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	NPY4R	P50391	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TAF13	Q15543	124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PKP2	Q99959	881 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1B0GUS0	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	BHLHE40	O14503	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFA7	O95182	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TSPAN15	O95858	294 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	LIPF	P07098	398 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	BPIFB3	P59826	476 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PNKD	Q8N490	385 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	UBE2F	Q969M7	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	COPS4	Q9BT78	406 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078		M0QZ24	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CLU	P10909	449 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	IER3	P46695	156 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	GSS	P48637	474 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SMIM11A	P58511	58 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CSNK2B	P67870	215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	IKZF1	Q13422	519 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PDCD1	Q15116	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR8S1	Q8NH09	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC29	Q8WV35	223 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DYRK2	Q92630	601 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DDO	Q99489	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A4	Q9H015	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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