RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 RHOXF1Q8NHV9 184 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SFXN5Q8TD22 340 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CYGBQ8WWM9 190 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 LCN9Q8WX39 176 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SLC7A6Q92536 515 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GALMQ96C23 342 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3IP1Q96FE7 263 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 WBP1Q96G27 269 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FCRL1Q96LA6 429 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TSSK2Q96PF2 358 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX3Q96PT4 197 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DDOQ99489 341 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ATF6BQ99941 703 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 C20orf144Q9BQM9 153 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MESP1Q9BRJ9 268 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 REG4Q9BYZ8 158 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DPAGT1Q9H3H5 408 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CST9LQ9H4G1 147 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CXorf21Q9HAI6 301 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRL4Q9HBW9 690 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 BPIFA1Q9NP55 256 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 AMBNQ9NP70 447 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SPHK2Q9NRA0 654 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PLSCR3Q9NRY6 295 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR1A1Q9P1Q5 309 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4Q9UBX2 424 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 RIC1Q4ADV7 1423 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 ERVK-7P63135 1459 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HEG1Q9ULI3 1381 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.66□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM218A2RU14 115 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ANKUB1A6NFN9 424 aa2.66□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 SIRPB1O00241 398 aa2.66□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 PRKAB2O43741 272 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GNG7O60262 68 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR7C2O60412 319 aa2.66□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 IRF2P14316 349 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GP9P14770 177 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GATA3P23771 443 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB25P24278 435 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FASP25445 335 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HTR1EP28566 365 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MPGP29372 298 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NTSP30990 170 aa2.66□□□□□ -1.98
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