RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	CDC42EP2	O14613	210 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DIRAS1	O95057	198 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MT-ND2	P03891	347 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FMO3	P31513	532 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	GGT2	P36268	569 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR4	P46093	362 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LCN2	P80188	198 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SPIB	Q01892	262 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		Q6ZNX1	250 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	S100Z	Q8WXG8	99 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MRI1	Q9BV20	369 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	EMC7	Q9NPA0	242 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	RHCG	Q9UBD6	479 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120		H7C1C5	153 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120		J3KTA2	159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	XPNPEP2	O43895	674 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	PFDN1	O60925	122 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	INMT	O95050	263 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ALX3	O95076	343 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	CTLA4	P16410	223 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	CRABP1	P29762	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	LCN6	P62502	163 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	BAMBI	Q13145	260 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	OCLN	Q16625	522 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	DGUOK	Q16854	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	MICA	Q29983	383 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	DOK3	Q7L591	496 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SGCD	Q92629	289 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120		Q96M85	177 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	COQ7	Q99807	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	NUP50	Q9UKX7	468 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC30	A6NM36	301 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	CLDN34	H7C241	214 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	MPZL2	O60487	215 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	CCNB2	O95067	398 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	TXNDC12	O95881	172 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SBK2	P0C263	348 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SELE	P16581	610 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	RHCE	P18577	417 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	PSMB9	P28065	219 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC6A9	P48067	706 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	MMP16	P51512	607 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	HMGA2	P52926	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF154	Q13106	437 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	TMED1	Q13445	227 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	CTF1	Q16619	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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