RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525121.2

HMGB1P40-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 40, humanhuman

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Gene HMGB1P40, Length 540 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC16A6O15403 523 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 GMDSO60547 372 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ENTPD6O75354 484 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SULT1C4O75897 302 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 NCR1O76036 304 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 APOL3O95236 402 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 LYNX1P0DP58 116 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ATP6V1B1P15313 513 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 PCMT1P22061 227 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 CA6P23280 308 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 MAP2K3P46734 347 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 GSK3AP49840 483 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 HCCSP53701 268 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 EFNB1P98172 346 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF91Q05481 1191 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC34A1Q06495 639 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ITPR2Q14571 2701 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 KLHL22Q53GT1 634 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 LPCAT4Q643R3 524 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 NAA40Q86UY6 237 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ERGIC1Q969X5 290 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SPSB4Q96A44 273 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SPG11Q96JI7 2443 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC29A1Q99808 456 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 GAL3ST1Q99999 423 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 MICU1Q9BPX6 476 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ADI1Q9BV57 179 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 GNG8Q9UK08 70 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 COPS3Q9UNS2 423 aa4.59□□□□□ -1.67
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HMGB1P40-201ENST00000525121 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 R4GMQ9 66 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P40-201ENST00000525121 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 A0A1B0GVI7 797 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.58□□□□□ -1.68
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HMGB1P40-201ENST00000525121 F5H5P2 479 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 H0YAE9 185 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RP2O75695 350 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LY6G6DO95868 133 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 HLA-DPB1P04440 258 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF12P17014 697 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MYL12AP19105 171 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 HNF1AP20823 631 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 COL8A2P25067 703 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CAPGP40121 348 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CD200P41217 278 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 HSPA13P48723 471 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MMP16P51512 607 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 PRSS12P56730 875 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FAM3AP98173 230 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MVKQ03426 396 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RAB40BQ12829 278 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RIN1Q13671 783 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR8B8Q15620 311 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 KCNJ8Q15842 424 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 AVPI1Q5T686 147 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF691Q5VV52 312 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CYB5R2Q6BCY4 276 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FAM166AQ6J272 317 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 Q6ZR03 302 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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