RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ACTBP60709 375 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ACTG1P63261 375 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 QRFPP83859 136 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 FAPQ12884 760 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CDK10Q15131 360 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 A0A0U1RQV5 110 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TMEM235A6NFC5 223 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ARGFXA6NJG6 315 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SULT1C2O00338 296 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 APOC1P02654 83 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CST2P09228 141 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 PATE4P0C8F1 98 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF774Q6NX45 483 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CMBLQ96DG6 245 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ICMTO60725 284 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 PRAF2O60831 178 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SP1P08047 785 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RCVRNP35243 200 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RAD52P43351 418 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CLDN18P56856 261 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RAB35Q15286 201 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RAB12Q6IQ22 244 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CDH24Q86UP0 819 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CHST4Q8NCG5 386 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 FOXB1Q99853 325 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TNFRSF10AO00220 468 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 FABP7O15540 132 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 IGLV3-1P01715 115 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-9P01782 118 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR3A4PP47883 348 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 MEOX1P50221 254 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 GPER1Q99527 375 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 GPR35Q9HC97 309 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GUH1 482 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 FAM172BPA6NC97 362 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RAB27BO00194 218 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 DHRS3O75911 302 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TGM6O95932 706 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZTK2 550 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 DTX1Q86Y01 620 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 GINS4Q9BRT9 223 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 EMC3Q9P0I2 261 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SYNGR3O43761 229 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 NME2P1O60361 137 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ANXA3P12429 323 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 FAHP16930 419 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF708P17019 499 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF32P17041 273 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 NME2P22392 152 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 MEIOBQ8N635 442 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 MDS2Q8NDY4 140 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 WIPF3A6NGB9 483 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ITGB2P05107 769 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CRYGSP22914 178 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 TAS2R19P59542 299 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 OR10A2Q9H208 303 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 V9GYS6 101 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 SYNGR4O95473 234 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CYB5AP00167 134 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 ECH1Q13011 328 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-216ENST00000492723 CDNFQ49AH0 187 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms