RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 SPSB4Q96A44 273 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 PELI1Q96FA3 418 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 PERPQ96FX8 193 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 LYZL4Q96KX0 146 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 SOX7Q9BT81 388 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TPK1Q9H3S4 243 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OPA3Q9H6K4 179 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MSL2Q9HCI7 577 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 GPR84Q9NQS5 396 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 GPR160Q9UJ42 338 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ITPR2Q14571 2701 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 RTTNQ86VV8 2226 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 PDZD2O15018 2839 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ROS1P08922 2347 aa7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 A0A0U1RQV5 110 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CD300LBA8K4G0 201 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OVOL3O00110 214 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 P2RY10O00398 339 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MYL12BO14950 172 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 SPRY3O43610 288 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 RGS10O43665 173 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFS7O75251 213 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MT-ND2P03891 347 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 KIR3DL2P43630 455 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 PTH2RP49190 550 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 GSK3AP49840 483 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF81P51508 661 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MMP15P51511 669 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 FAM3AP98173 230 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 KLBQ86Z14 1044 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR52N1Q8NH53 320 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 NINJ1Q92982 152 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 RGCCQ9H4X1 137 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 DUSP21Q9H596 190 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC42Q9Y546 428 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CACNA1DQ01668 2161 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 DSCAMO60469 2012 aa7.54□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GVI7 797 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 C17orf100A8MU93 164 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 H7C417 338 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 LY6HO94772 140 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 HLA-DPB1P04440 258 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CA6P23280 308 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ACKR3P25106 362 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MAGEB1P43366 347 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ATP5J2P56134 94 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CCL8P80075 99 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TNK1Q13470 666 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 XAF1Q6GPH4 301 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 Q6ZR03 302 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 RDH10Q8IZV5 341 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR8G5Q8NG78 346 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MBD6Q96DN6 1003 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MND1Q9BWT6 205 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM100Q9NV29 134 aa7.53□□□□□ -1.2
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms