RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 NRAPQ86VF7 1730 aa15.49■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.073e-7■■■■□ 21.9
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PTPRF-209ENST00000438120 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 APH1BQ8WW43 257 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRF-209ENST00000438120 TTC9Q92623 222 aa15.46■□□□□ 0.07
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