RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 OR1D4P47884 311 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC119Q13432 240 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 HOGA1Q86XE5 327 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCC1Q96S66 551 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 THADAQ6YHU6 1953 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CD5P06127 495 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GP1BBP13224 206 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IL11P20809 199 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LPAR6P43657 344 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRA4P48169 554 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NUBPLQ8TB37 319 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXQ1Q9C009 403 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NIT2Q9NQR4 276 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PPC4 97 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C9JQL5 133 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPP3O14495 311 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IGKV3-11P04433 115 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF44P15621 663 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GNB3P16520 340 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GALNSP34059 522 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GFERP55789 205 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF721Q8TF20 911 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST1H2BAQ96A08 127 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 AQP10Q96PS8 301 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH15Q96QU1 1955 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SSX5O60225 188 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NPIPB7O75200 414 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 DDAH2O95865 285 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 S100A6P06703 90 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PGCP20142 388 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FGGYQ96C11 551 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE7BQ9NP56 450 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LRP3O75074 770 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MED6O75586 246 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAP1O75689 374 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TBPP20226 339 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPZBP47756 277 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PPT1P50897 306 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 EFNA3P52797 238 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ST7LQ8TDW4 575 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC61Q9BV99 259 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR27Q9NS67 375 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MFNGO00587 321 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ISG15P05161 165 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FCGR3AP08637 254 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GNALP38405 381 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 QRFPP83859 136 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 BTNL8Q6UX41 500 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC26A10Q8NG04 563 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TGM7Q96PF1 710 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB18Q9NP72 206 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPMQ9NSP4 180 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR13Q9NZ81 148 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TINAGQ9UJW2 476 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ALG1L2C9J202 215 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM157AC9JC47 383 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 AGPAT2O15120 278 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO24O75426 580 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NME2P22392 152 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CRABP1P29762 137 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CD80P33681 288 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 HGFACQ04756 655 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms