RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ITFG2Q969R8 447 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SGK3Q96BR1 496 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 NEK6Q9HC98 313 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 STARD10Q9Y365 291 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GTI1 187 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 MAGEB3O15480 346 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SMPD2O60906 423 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 IL1AP01583 271 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SRMP19623 302 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CCL1P22362 96 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TGFBR1P36897 503 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 MTNR1BP49286 362 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SPCS2Q15005 226 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 DGUOKQ16854 277 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CNPY1Q3B7I2 92 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 FTMTQ8N4E7 242 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 OR5D14Q8NGL3 314 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 NDNFQ8TB73 568 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 FGGYQ96C11 551 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf35Q96D05 121 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 LYZL4Q96KX0 146 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 V9GYS6 101 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PPW3 197 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ANXA2P2A6NMY6 339 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DHRS7CA6NNS2 312 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NGFP01138 241 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV3-1P01715 115 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF35P13682 527 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SELEP16581 610 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RAB3AP20336 220 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RAB3BP20337 219 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CD40P25942 277 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GCH1P30793 250 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SDC2P34741 201 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 THBS4P35443 961 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 WNT5AP41221 380 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MAGEB1P43366 347 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF92Q03936 586 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF718Q3SXZ3 478 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FAM27D1Q5T7N8 215 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CROCCP3Q8IVE0 287 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF101Q8IZC7 436 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR14K1Q8NGZ2 314 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PP6455Q8WZ26 134 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SPSB4Q96A44 273 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TPK1Q9H3S4 243 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FOXJ3Q9UPW0 622 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MEGF11A6BM72 1044 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 C5orf63A6NC05 138 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 VSTM5A8MXK1 200 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ICMTO60725 284 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MAS1P04201 325 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FSTP19883 344 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CALCRP30988 508 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DDOSTP39656 456 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RANBP1P43487 201 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GSK3AP49840 483 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RORCP51449 518 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PSMD7P51665 324 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SELENOVP59797 346 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FAM3AP98173 230 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SPATA46Q5T0L3 261 aa10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms