RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 OR2Z1Q8NG97 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 OR5B3Q8NH48 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 CD3DP04234 171 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 PTOV1Q86YD1 416 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 DLL4Q9NR61 685 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 OSR2Q8N2R0 312 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 PDCD1Q15116 288 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 B9D1Q9UPM9 204 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 CORO2AQ92828 525 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 A4GNTQ9UNA3 340 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 R4GN57 208 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 PIGPP57054 158 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 OR5H1A6NKK0 313 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 FBXW5Q969U6 566 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF835Q9Y2P0 537 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 20.5
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PTPRM-201ENST00000332175 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 DRAM2Q6UX65 266 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 MGMTP16455 207 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 UBALD1Q8TB05 177 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 CACNA1SQ13698 1873 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WUJ7 227 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 FOXB1Q99853 325 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R45P59539 299 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF90Q03938 601 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 TMED6Q8WW62 240 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 HIST2H3AQ71DI3 136 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 DDOSTP39656 456 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 FAM122AQ96E09 287 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 TIMM9Q9Y5J7 89 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 FZD6O60353 706 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 LALBAP00709 142 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 RPL12P30050 165 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 CDH26Q8IXH8 852 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 GALMQ96C23 342 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 ATF1P18846 271 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 RAB1AP62820 205 aa20.15■□□□□ 0.82
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