RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 SHDQ96IW2 340 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PNV4 684 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HMSDA8MTL9 139 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PGA4P0DJD7 388 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PGA3P0DJD8 388 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C4BPBP20851 252 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CAPZA1P52907 286 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CDNFQ49AH0 187 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GTI1 187 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RER1O15258 196 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PMS2P2O95744 297 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CD74P04233 296 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PPP3CBP16298 524 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GNB3P16520 340 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SSTP61278 116 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 QRFPP83859 136 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR2M3Q8NG83 312 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TCEAL3Q969E4 200 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RASL10BQ96S79 203 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RAB22AQ9UL26 194 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 VSIG4Q9Y279 399 aa14.5□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 COL6A3P12111 3177 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS2Q13268 280 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 THEM4Q5T1C6 240 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 COMMD2Q86X83 199 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NICN1Q9BSH3 213 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 UPB1Q9UBR1 384 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MIOXQ9UGB7 285 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR14I1A6ND48 311 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RP2O75695 350 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MELTFP08582 738 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CXADRP78310 365 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MUC3AQ02505 3323 aa14.49□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CCSO14618 274 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HSD11B1P28845 292 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 LIN54Q6MZP7 749 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC107Q8WV48 283 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PTX4Q96A99 478 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0A6YYH2 397 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 A6NJ64 397 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 IGHG1P01857 330 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RAB6AP20340 208 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MSX1P28360 303 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 EDEM2Q9BV94 578 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MFFQ9GZY8 342 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HTR3BO95264 441 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SPP1P10451 314 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MC2RQ01718 297 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MPPED2Q15777 294 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PHF19Q5T6S3 580 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 AWAT2Q6E213 333 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN23Q96B33 292 aa14.48□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms