RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 DHRS3O75911 302 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 UBBP0CG47 229 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 SULT1A3P0DMM9 295 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 SULT1A4P0DMN0 295 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 ANXA3P12429 323 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 CRYGSP22914 178 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 NTF4P34130 210 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 BCL2A1Q16548 175 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFA5Q16718 116 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 DTX1Q86Y01 620 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 PP6455Q8WZ26 134 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 AQP3Q92482 292 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 MED12Q93074 2177 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 RAB27BO00194 218 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 SGCEO43556 437 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 NME2P1O60361 137 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 MELTFP08582 738 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 VSIG8P0DPA2 414 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 GTF2F2P13984 249 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 PRF1P14222 555 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 NME2P22392 152 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 SOX8P57073 446 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 PCBD1P61457 104 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 GUCA2AQ02747 115 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 UTS2BQ765I0 119 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 MDS2Q8NDY4 140 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 OR11H7Q8NGC8 314 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00470Q9BZP3 86 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 OR10A4Q9H209 315 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 KNTC1P50748 2209 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF708P17019 499 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 RCVRNP35243 200 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A9P48067 706 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 VEGFCP49767 419 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN18P56856 261 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 UNC119Q13432 240 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 AWAT2Q6E213 333 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 MEIOBQ8N635 442 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SLC39A7Q92504 469 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 FOXB1Q99853 325 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 OR10A2Q9H208 303 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 RNF122Q9H9V4 155 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 GHRLQ9UBU3 117 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SNRPGP15A8MWD9 76 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SYNGR3O43761 229 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SP1P08047 785 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 CHRM2P08172 466 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 CPN1P15169 458 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 STEAP1BQ6NZ63 245 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 LYZL4Q96KX0 146 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SOX7Q9BT81 388 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ING4Q9UNL4 249 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 MEIKINA0A087WXM9 373 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 RRADP55042 308 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 OR10K2Q6IF99 312 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 GABRG1Q8N1C3 465 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 GALNT16Q8N428 558 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 OR1F12Q8NHA8 337 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 GPR35Q9HC97 309 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ALDH3B1P43353 468 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 ABHD3Q8WU67 409 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 HES7Q9BYE0 225 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD9-201ENST00000249499 NPTNQ9Y639 398 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms