RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 KLK2P20151 261 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 BMP5P22003 454 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 EDNRAP25101 427 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 STOMP27105 288 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CDAP32320 146 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 DDOSTP39656 456 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 HTR5AP47898 357 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINB10P48595 397 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SELENOVP59797 346 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 RAB1AP62820 205 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF85Q03923 595 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 RAB39AQ14964 217 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ETFDHQ16134 617 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 GABRA6Q16445 453 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 XAF1Q6GPH4 301 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TPRA1Q86W33 373 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC18Q8N456 261 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PELI1Q96FA3 418 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC120Q96HB5 630 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TBX5Q99593 518 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MRI1Q9BV20 369 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 JKAMPQ9P055 326 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 AASSQ9UDR5 926 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 GPR160Q9UJ42 338 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TINAGQ9UJW2 476 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 HHLA2Q9UM44 414 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 STUB1Q9UNE7 303 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0G2JNJ9 132 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GVI7 797 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SHISA3A0PJX4 238 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 M0R135 149 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PDCD5O14737 125 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SYNGR3O43761 229 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 AIREO43918 545 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 TOXO94900 526 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ATE1O95260 518 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MPZL1O95297 269 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-9P01782 118 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CRYAAP02489 173 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 SELEP16581 610 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 IGHV1-2P23083 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MYL9P24844 172 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SOX6P35712 828 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MAP2K4P45985 399 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 OR12D2P58182 307 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 GALK2Q01415 458 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MZT1Q08AG7 82 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CDK5R1Q15078 307 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 FAM189A2Q15884 450 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MLANAQ16655 118 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 VWA1Q6PCB0 445 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 DOK3Q7L591 496 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 KLBQ86Z14 1044 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 PHC2Q8IXK0 858 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 AP3S1Q92572 193 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 GHSRQ92847 366 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF799Q96GE5 643 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PGAM5Q96HS1 289 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 KCTD7Q96MP8 289 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 DOK1Q99704 481 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A4Q9H015 551 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CDH20Q9HBT6 801 aa6.38□□□□□ -1.39
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