RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 GHSRQ92847 366 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 A1L4Q6 167 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 C19orf84I3L1E1 186 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 CASKO14936 926 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 XRCC2O43543 280 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 RAD52P43351 418 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 UCP2P55851 309 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 TRAM1Q15629 374 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 OR5L1Q8NGL2 311 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 FAM222BQ8WU58 562 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ITFG2Q969R8 447 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SGK3Q96BR1 496 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 YIPF6Q96EC8 236 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 RGCCQ9H4X1 137 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 C5orf63A6NC05 138 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SMPD2O60906 423 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 NGFP01138 241 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 CCL1P22362 96 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 NR4A1P22736 598 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ANOS1P23352 680 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 TGFBR2P37173 567 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 KIR2DL3P43628 341 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SLC3A1Q07837 685 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 BEX5Q5H9J7 111 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 Q6ZSR3 168 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 GPR141Q7Z602 305 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SPSB4Q96A44 273 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 STARD10Q9Y365 291 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 MAST4O15021 2626 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 PLCE1Q9P212 2302 aa16.14■□□□□ 0.18
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1B0GTI1 187 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 TBX1O43435 398 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 CD36P16671 472 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 ACHEP22303 614 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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SPNS1-210ENST00000568388 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 ABHD4Q8TB40 342 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 RADILQ96JH8 1075 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 OPA3Q9H6K4 179 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 CLDN1O95832 211 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 GALP22466 123 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 MALLQ13021 153 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 NUP37Q8NFH4 326 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 PLPPR2Q96GM1 343 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 LYZL4Q96KX0 146 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 GPR84Q9NQS5 396 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 HHLA2Q9UM44 414 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 DEFB108AA8MXU0 73 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 P2RY10O00398 339 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 ABCD4O14678 606 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 SC5DO75845 299 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 ATE1O95260 518 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 SERPINA3P01011 423 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 HLA-DPB1P04440 258 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 FAM157BP0CG42 384 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF12P17014 697 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 GLRXP35754 106 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1CBP62140 327 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS1-210ENST00000568388 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
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