RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 SYNGR3O43761 229 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 MPZL2O60487 215 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 DOK2O60496 412 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 SELENOFO60613 162 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 ENTPD6O75354 484 aa11.72□□□□□ -0.53
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CS-231ENST00000552222 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.72□□□□□ -0.53
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CS-231ENST00000552222 ST7LQ8TDW4 575 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 TFAP2CQ92754 450 aa11.72□□□□□ -0.53
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CS-231ENST00000552222 MAP6Q96JE9 813 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 JMJD8Q96S16 334 aa11.72□□□□□ -0.53
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CS-231ENST00000552222 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 C5orf49A4QMS7 147 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 PLPP2O43688 288 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 HTR5AP47898 357 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 TMED1Q13445 227 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 IL18R1Q13478 541 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 NUP37Q8NFH4 326 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 OTOSQ8NHW6 89 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 COQ7Q99807 217 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 CDH20Q9HBT6 801 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 AASSQ9UDR5 926 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 OPN4Q9UHM6 478 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 FZR1Q9UM11 496 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-231ENST00000552222 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.71□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ICMTO60725 284 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 NCR1O76036 304 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 GNAO1P09471 354 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 SBK2P0C263 348 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ALOX5APP20292 161 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 NR4A1P22736 598 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 VHLP40337 213 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ALDH3B1P43353 468 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ISL1P61371 349 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 IL5RAQ01344 420 aa11.7□□□□□ -0.54
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CS-231ENST00000552222 ECH1Q13011 328 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 KRT80Q6KB66 452 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 USP51Q70EK9 711 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 LRP11Q86VZ4 500 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 SETD9Q8NE22 299 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 APH1BQ8WW43 257 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 SLC7A6Q92536 515 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 Q96MT0 163 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ATF6BQ99941 703 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ABHD6Q9BV23 337 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 CLN6Q9NWW5 311 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 DBHP09172 617 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 CCNOP22674 350 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-231ENST00000552222 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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