RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 ST3GAL4Q11206 333 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 MSMPQ1L6U9 139 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDONQ4KMG0 1287 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 LIPNQ5VXI9 398 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PGAP1Q75T13 922 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR141Q7Z602 305 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDH24Q86UP0 819 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 STX19Q8N4C7 294 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 NINJ1Q92982 152 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SGK3Q96BR1 496 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ALG8Q9BVK2 526 aa9.64□□□□□ -0.87
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TRAPPC4-211ENST00000533012 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 POFUT1Q9H488 388 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.64□□□□□ -0.87
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TRAPPC4-211ENST00000533012 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 R4GMQ9 66 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CENPEQ02224 2701 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLSCR5A0PG75 271 aa9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC4-211ENST00000533012 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 J3QLW9 94 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 M0R233 179 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 XRCC2O43543 280 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TFAP2AP05549 437 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC159P0C7I6 412 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SELEP16581 610 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF19P17023 458 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 LIPAP38571 399 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 MPV17P39210 176 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR12D2P58182 307 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PSG7Q13046 419 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TIGD6Q17RP2 521 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TP53I3Q53FA7 332 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 AHSA2Q719I0 299 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGFBPL1Q8WX77 278 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 MYDGFQ969H8 173 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 RGCCQ9H4X1 137 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 OPA3Q9H6K4 179 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM206AQ9NX38 181 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 C5orf63A6NC05 138 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 GGT3PA6NGU5 568 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 VGLL3A8MV65 326 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 OVOL3O00110 214 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC1A7O00341 560 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 PNPP00491 289 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADRA2AP08913 450 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ALDH3B1P43353 468 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ALDH3B2P48448 385 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ETV1P50549 477 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF92Q03936 586 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR2T2Q6IF00 324 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF773Q6PK81 442 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SATL1Q86VE3 508 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SYS1Q8N2H4 156 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SVOPQ8N4V2 548 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 RORBQ92753 470 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPSB4Q96A44 273 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 MBD6Q96DN6 1003 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC4-211ENST00000533012 REEP6Q96HR9 211 aa9.62□□□□□ -0.87
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