RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 GABRA4P48169 554 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TWF1Q12792 350 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 C1orf61Q13536 156 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PYCR3Q53H96 274 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 C11orf88Q6PI97 169 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRC8AQ8IWT6 810 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 C3orf22Q8N5N4 141 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR10T2Q8NGX3 314 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM243Q9BU79 118 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MS4A8Q9BY19 250 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NIT2Q9NQR4 276 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 DENND4AQ7Z401 1863 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRPM6Q9BX84 2022 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 C17orf98A8MV24 154 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NT5EP21589 574 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 GNA11P29992 359 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CFHR2P36980 270 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 HSD17B2P37059 387 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 COILP38432 576 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUCB1Q02818 461 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLRB1Q12918 225 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHIT1Q13231 466 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPIN4Q56A73 249 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CNSTQ6PJW8 725 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MDP1Q86V88 176 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR8H2Q8N162 312 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR52E1Q8NGJ3 308 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR4C16Q8NGL9 310 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ENKURQ8TC29 256 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNS1Q96KK3 526 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NSMCE2Q96MF7 247 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TTC25Q96NG3 672 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SH3GL1Q99961 368 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CES1P1Q9UKY3 287 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAB22AQ9UL26 194 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 LCTP09848 1927 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CFAP73A6NFT4 308 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ERLIN2O94905 339 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR4F21O95013 312 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TPRXLQ17RH7 258 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR6B2Q6IFH4 312 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NOXRED1Q6NXP6 359 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPINK6Q6UWN8 80 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNG3Q8TAE7 436 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 GDAP1Q8TB36 358 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAB33BQ9H082 229 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMIM26A0A096LP01 95 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ISPDA4D126 451 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TP53I11O14683 189 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAMP3O60896 148 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NEBLO76041 1014 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR7A10O76100 309 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPR4P46093 362 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 RND2P52198 227 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARF5P84085 180 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 HSF2Q03933 536 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NCF4Q15080 339 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 FILIP1LQ4L180 1135 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 LFNGQ8NES3 379 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MFSD8Q8NHS3 518 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC41A3Q96GZ6 507 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPP1R36Q96LQ0 422 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MFFQ9GZY8 342 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MED4Q9NPJ6 270 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CA10Q9NS85 328 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 NPTNQ9Y639 398 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 BTBD17A6NE02 478 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 BTN3A3O00478 584 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLPP1O14494 284 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLDN3O15551 220 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRKAB2O43741 272 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 VPS26AO75436 327 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 GOSR1O95249 250 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-772P-201ENST00000516042 MBD3O95983 291 aa-1.22□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms