RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483212.1

USP4-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 727 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-210ENST00000483212 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 A0A1W2PPW3 197 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 C5orf49A4QMS7 147 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 CCDC160A6NGH7 325 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 ODF4Q2M2E3 257 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 Q499Y3 187 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 MTFR2Q6P444 385 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 GPR148Q8TDV2 347 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 SGK3Q96BR1 496 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 PGAM5Q96HS1 289 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 PAX7P23759 505 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 KRT74Q7RTS7 529 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 DACH2Q96NX9 599 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 OR10A2Q9H208 303 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP4-210ENST00000483212 NOX4Q9NPH5 578 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 CHD6Q8TD26 2715 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-210ENST00000483212 A0A0G2JK05 382 aa7.11□□□□□ -1.27
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