RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 POM121CA8CG34 1229 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 PPIAL4DF5H284 164 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 RER1O15258 196 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 CDC14BO60729 498 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 NCR1O76036 304 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 IFNGP01579 166 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 IGHV2-5P01817 119 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 ZNF3P17036 446 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 WNT5AP41221 380 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 CCL8P80075 99 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 MVKQ03426 396 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 CRMP1Q14194 572 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 ARL9Q6T311 187 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 TREML4Q6UXN2 200 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 SYT9Q86SS6 491 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A6Q92536 515 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 GAL3ST1Q99999 423 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 CMC2Q9NRP2 79 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-210ENST00000442481 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PLSCR5A0PG75 271 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 TVP23AA6NH52 213 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 FAM183AA6NL82 134 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 WNT9BO14905 357 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MPZL2O60487 215 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 FOXH1O75593 365 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 GYPBP06028 91 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF250P15622 560 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF823P16415 610 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PRTN3P24158 256 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 FMO3P31513 532 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB1P43366 347 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ISL1P61371 349 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PPP1CBP62140 327 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 IL13RA1P78552 427 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CDK5R2Q13319 367 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 AVPI1Q5T686 147 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR2T4Q8NH00 348 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 TMEM163Q8TC26 289 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 APH1BQ8WW43 257 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 C4orf45Q96LM5 186 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 WACQ9BTA9 647 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MED20Q9H944 212 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CLN6Q9NWW5 311 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 A0A0G2JK05 382 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 FAM20BO75063 409 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 NGFP01138 241 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 AVPP01185 164 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 DBHP09172 617 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 GABRB1P18505 474 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 LIPAP38571 399 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MPV17P39210 176 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 DEFA6Q01524 100 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 KCNMB1Q16558 191 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms