RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424011.6

CMTM3-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CMTM3, Length 2,330 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-202ENST00000424011 CENPMQ9NSP4 180 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 ETV7Q9Y603 341 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 PROB1E7EW31 1015 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 H7C2Y5 167 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 QDPRP09417 244 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 GIFP27352 417 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 GDNFP39905 211 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 MMP16P51512 607 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 RAC3P60763 192 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 KCNMB1Q16558 191 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 A0A0G2JMM0 328 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 A0A1W2PPB8 328 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 A0A1W2PRS3 328 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FAM74A7A6NL05 159 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TNFSF11O14788 317 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 MT-ND4P03905 459 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TCRBP04435 133 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CD82P27701 267 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 PLA2G7Q13093 441 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 HHLA2Q9UM44 414 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 ZNF292O60281 2723 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 A0A0J9YW62 118 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TTLL8A6PVC2 850 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 RGS11O94810 467 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TOXO94900 526 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 APOC3P02656 99 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 SDHBP21912 280 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 ACHEP22303 614 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CSNK1A1P48729 337 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 PTH2RP49190 550 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CCR6P51684 374 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 TSPAN5P62079 268 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FGL1Q08830 312 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 ST3GAL2Q16842 350 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CORO6Q6QEF8 472 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 OR52I2Q8NH67 350 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 HAVCR1Q96D42 359 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CACNA1CQ13936 2221 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM3-202ENST00000424011 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 TM4SF5O14894 197 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 TRAPPC6AO75865 159 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 PTHLHP12272 177 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 ITGA3P26006 1051 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CFPP27918 469 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CD96P40200 585 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 ART1P52961 327 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 GSG1Q2KHT4 349 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 SDK2Q58EX2 2172 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 FREM3P0C091 2139 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 ZNF878C9JN71 531 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 SNAPINO95295 136 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CDK2P24941 298 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 GDF1P27539 372 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM3-202ENST00000424011 CARD18P57730 90 aa14.64□□□□□ -0.07
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