RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.13□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.13□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.13□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 HS3ST1O14792 307 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TUBG1P23258 451 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 DTX3Q8N9I9 347 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SLC39A7Q92504 469 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TMEM68Q96MH6 324 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NOX3Q9HBY0 568 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CEP350Q5VT06 3117 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ASPDHA6ND91 283 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SULT1B1O43704 296 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MED6O75586 246 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 B3GALNT1O75752 331 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 IFNA17P01571 189 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SNCAP37840 140 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TGM4P49221 684 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TPBGQ13641 420 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TSSK2Q96PF2 358 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 GPR35Q9HC97 309 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ALG5Q9Y673 324 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SIRPB1O00241 398 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 IFNA1P01562 189 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FOSL1P15407 271 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TNK1Q13470 666 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 RTL8BQ17RB0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 STX12Q86Y82 276 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PHOX2BQ99453 314 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 UTRNP46939 3433 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TRIM64BA6NI03 449 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 HLA-HP01893 362 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PTAFRP25105 342 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PMP22Q01453 160 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 BEX5Q5H9J7 111 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CACNG2Q9Y698 323 aa7.12□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PR80 420 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR5B21A6NL26 309 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TUSC2O75896 110 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CELA2AP08217 269 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TAS2R20P59543 309 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FAM209AQ5JX71 171 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ZNF774Q6NX45 483 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CNIH1O95406 144 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FABP1P07148 127 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NRG4Q8WWG1 115 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ST8SIA4Q92187 359 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR8B2Q96RD0 313 aa7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms