RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SPACA5Q96QH8 159 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 CHST2Q9Y4C5 530 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 RPS27P42677 84 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 RELAQ04206 551 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA46Q5T0L3 261 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 MGST1P10620 155 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 F2RP25116 425 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 DUSP1P28562 367 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 OR2B11Q5JQS5 317 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 CARFQ8N187 725 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 UBE2G2P60604 165 aa18.23■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 CRYZL1O95825 349 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 CSN1S1P47710 185 aa18.23■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A26Q70HW3 274 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SIAEQ9HAT2 523 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 B9D1Q9UPM9 204 aa18.23■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM215Q68D42 235 aa18.23■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 C15orf54Q8N8G6 183 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 UBAC2Q8NBM4 344 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.23■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 OPCMLQ14982 345 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC10Q5BKY1 277 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 PPT1P50897 306 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF85Q03923 595 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 RPS19P39019 145 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 RAB1AP62820 205 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 VASH2Q86V25 355 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 PEX11BO96011 259 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 POU2F2P09086 479 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 CDAP32320 146 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A46Q96AG3 418 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.22■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC22A13Q9Y226 551 aa18.22■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 PSMB3P49720 205 aa18.22■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 THNSL2Q86YJ6 484 aa18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 IMPA2O14732 288 aa18.21■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 TAF9Q16594 264 aa18.21■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 GNRHR2Q96P88 292 aa18.21■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 HPNP05981 417 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF83P51522 516 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 DVL1O14640 695 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ST8SIA3O43173 380 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 FUT6P51993 359 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SLC30A7Q8NEW0 376 aa18.21■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 OR1F12Q8NHA8 337 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 RNF141Q8WVD5 230 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 OTPQ5XKR4 325 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ARPC3O15145 178 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 CTSVO60911 334 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
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