RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.36■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.36■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF879B4DU55 563 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCL21O00585 134 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 STOMP27105 288 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOXC12P31275 282 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINB10P48595 397 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 Q499Y3 187 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR31Q8NA23 367 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHYHIPQ92561 330 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 JKAMPQ9P055 326 aa20.35■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 LOC100509620A0A075B734 347 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PR80 420 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 OCM2P0CE71 109 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANOS1P23352 680 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 HGFACQ04756 655 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYO7BQ6PIF6 2116 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 NBASA2RRP1 2371 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINA5P05154 406 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGEB1P43366 347 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 HHLA2Q9UM44 414 aa20.34■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.33■□□□□ 0.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR5H1A6NKK0 313 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 P2RY10O00398 339 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 UCHL1P09936 223 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACHEP22303 614 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL32P24001 234 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 PGAM5Q96HS1 289 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 DERL3Q96Q80 235 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.33■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PPK0 400 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 H3BSH0 61 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARL6IP5O75915 188 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 SDC2P34741 201 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASB5Q8WWX0 329 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 MED18Q9BUE0 208 aa20.32■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 SHISA3A0PJX4 238 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 C5orf49A4QMS7 147 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 C5orf63A6NC05 138 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIN1P1O15428 100 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPS19P39019 145 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 SOX2P48431 317 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM27E3Q08E93 113 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNAI3Q3KNW1 292 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 THRSPQ92748 146 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM106AQ96A25 262 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 SP140LQ9H930 580 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOX4Q9NPH5 578 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0U1RQV5 110 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDRT1O95170 752 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL1AP01583 271 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAF1P04049 648 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 LCATP04180 440 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCL2P13500 99 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBR1P16152 277 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 KALRNO60229 2985 aa20.31■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1B0GTI1 187 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBX1O43435 398 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYT7O43581 403 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGKV3-15P01624 115 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGLV3-1P01715 115 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCNOP22674 350 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 APLNRP35414 380 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTNR1BP49286 362 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 FJX1Q86VR8 437 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 S100PBPQ96BU1 408 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR10A2Q9H208 303 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR84Q9NQS5 396 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 DHDHQ9UQ10 334 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.3■□□□□ 0.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms