RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSG1Q2KHT4 349 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 FJX1Q86VR8 437 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 COMMD2Q86X83 199 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSC22D3Q99576 134 aa15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GUH1 482 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PR80 420 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM30A4D0T7 59 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBX1O43435 398 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL6IP5O75915 188 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTRP02766 147 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 COX5AP20674 150 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCNOP22674 350 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOX6P35712 828 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGFBP7Q16270 282 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8B12Q8NGG6 310 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRR7Q8TB68 274 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOX4Q9NPH5 578 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHDHQ9UQ10 334 aa15.02□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL1AP01583 271 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRYGSP22914 178 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 DRAM2Q6UX65 266 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF843Q8N446 348 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOX3Q9HBY0 568 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 HHLA2Q9UM44 414 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 KALRNO60229 2985 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ISG15P05161 165 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACHEP22303 614 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNLYP22749 145 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTFR2Q6P444 385 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MDP1Q86V88 176 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR51E1Q8TCB6 317 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHYHIPQ92561 330 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM106AQ96A25 262 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ORAI1Q96D31 301 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 DERL3Q96Q80 235 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GVI7 797 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 A8MXE2 369 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYT7O43581 403 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCATP04180 440 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 UCHL1P09936 223 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACSM4P0C7M7 580 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 STOMP27105 288 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED18Q9BUE0 208 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 B3GNT2Q9NY97 397 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF319Q9P2F9 582 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCNX1Q96RV3 2341 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHISA3A0PJX4 238 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C5orf49A4QMS7 147 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD2P06729 351 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCL2P13500 99 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL32P24001 234 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 APLNRP35414 380 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTNR1BP49286 362 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 RORCP51449 518 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 THRSPQ92748 146 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SP140LQ9H930 580 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIN1P1O15428 100 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 COX5BP10606 129 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRMP19623 302 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANOS1P23352 680 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHRNB4P30926 498 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 UQCRFS1P47985 274 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAV3P56539 151 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 HGFACQ04756 655 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C4orf17Q53FE4 359 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms